Primer Selection
Génome
sélectionner un fichier fasta :
sélectionner le type :
linéaire
circulaire
E-mail
Paramètres
AIDE
Généraux
Taille des amorces :
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
Répétition de nt :
Contenu en GC :
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
Structures secondaires (hairpin)
Tige :
2
3
4
5
Boucle :
3
4
5
6
7
Stabilité de l'amorce
Stabilité en 5' (deltaG 5' sur les 5 premiers nt) :
(en moyenne de -7000 à -10500)
Stabilité en 3' (deltaG 3' sur les 5 derniers nt) :
min (de -7000 à -13000)
max (de -4000 à -6000)
Auto-complémentarité
Nb de matches maximum :
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
DeltaG (pour un match L>4pb) :
DeltaG 3' (pour un match L>3pb sur les 10 derniers nt) :
Similarité
Zone à explorer :
10000
15000
20000
30000
40000
50000
60000
70000
Nb de matches maximum :
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
Nb de gaps maximum :
0
1
2